MUSEO EGIPCIO contiene lapidas e inscripciones de diversas épocas, sarcófagos e momias, estatuas de época romana, cerámicas de la protohistoria ala época romana, tabletas cuneiformes, precinto mesopotámico, asirios bajorrelieves asiria provenientes de Nínive.
MUSEO CHIARAMANTI toma el nombre del linaje de los fundadores, Pio VII Chiaramonti 1800-23, que confió el ordenamiento a Canova. El Museo comprende el Corredor, la Galería Lapidaria y el brazo Nuevo. En el corredor , dividido en 60 secciones, se puede admirar una interminable serie de estatuas, bustos, sarcófagos, relieves etc. Aproximadamente 800 obras greco-romanas.
MUSEO PIO CLEMENTINO
Los ambientes del palacio de Belvedere alojan esculturas grecas y romanas como el apolo del Belvedere (130-140 d.c.), la estatua de Hermes (copia romana de edad adrianea de original greco en bronce del IV siglo a.c.), la Apoxymenos (copia del original en bronce de Lisippo), el grupo de Laocoonte, el Torso de Belvedere (obra neoattica del I siglo a.c.), la colosal estatua de Antinoo etc.
MUSEO GREGORIANO – ETRUSCO aloja las obras proveniente de las excavaciones echas sobe el territorio de la Etruria meridional. Después se enriqueció de varias adquisiciones y donaciones, convirtiéndose en una de las mas importantes recolecciones para el arte Etrusco.
ANTIQUARIUN ROMANO Esta subdividido en tres salas y recoge objetos antiguos sobretodo romanos y de artes menores.
RECOLECCION DE JARRONES aloja principalmente cerámica greca y etrusca en figuras negras.
SALA DE LA BIGA vino construida al tiempo de pio Vi (1775-99) y toma el nombre de la Biga, expuesta al centro de la sala, obra romana del I siglo d.c.
GALERIA DE LOS CANDELABROS Era una logia que al tiempo de Pio VI ha sido subdividida en arcadas que son sostenidas de columnas y pilastras, en correspondencia de las cuales son colocadas los candelabros, de las cuales la Galería toma el nombre.
GALERIA DE LOS TAPICES La galería, decoradas bajo Pio VI, toma el nombre delos tapices que le fueron expuestos en el 1814 y sucesivamente desde el 1838en adelante.
GALERIA DE LOS MAPAS GEOGRAFICOS La galería toma el nombre de los mapas geográficos pintadas sobre las paredes en 40 recuadros, cada uno dedicado a una región, una isla, a un particular del territorio de Italia.
SALA SOBIESKI Llamada así por la pintura que ocupa por entero la pared norte y representa la victoria de Giovanni III Sobieski, rey de Polonia, contra los Turcos bajo los muros de Viena en el 1683. La obra es de el polaco Jan Matejko (1883).
SALA DE LA INMACULADA Esta situada en la torre Borgia ha sido retratada por Francisco Podesti con escenas relativas al Dogma de la inmaculada Concepción promulgado por Pio IX.
HABITACIONES Y LOGIAS DE RAFAEL Las cuatro salas comúnmente llamadas “habitaciones de Rafael” constituían en conjunto con la Sala de los Claroscuros , ala vieja sala de los Suizos, al cubículo con estufa anexada, ala capilla Niccolina y ala logia, la nueva residencia escogida por Julio II en el segundo piso del palacio. Dispuestas en series comunicantes entre ellos, las cuatro habitaciones fueron construidas a los tiempos de Niccolo V (1447-55). A los fines del primer decenio del siglo XVI eran intencionados a la decoración el Perugino, el Sodoma, Baldassarre Peruzzi, el Bramantino, llamados por Julio II, el cual pero en el 1508 asigno solo a Rafael el encargo de pintarlo. El Sanzio le trabajo por aproximadamente un decenio, pero solo tres de las habitaciones se concluyeron antes de su muerte (1520).
COLECCION DE ARTE RELIGIOSA MODERNA Esta constituida de varios cientos de pinturas, esculturas, incisiones, diseños, donados de gente privada y de los mismos artistas ala Santa Sede, e instalados en 55 salas.
CAPILLA SIXTINA Meritadamente uno de los lugares mas famosos del mundo la Capilla Sixtina es el lugar donde se celebra el Conclave para la elección del Pontífice y se desarrollan funciones papales solemnes. Alzada entre el 1477 y el 1480, toma el nombre del Papa Sixto IV que fue quien ordeno su ejecución. Es un aula grande rectangular cubierta a cúpula , bipartida por una barrera de contención en mármol construida, con el palco para el coro, de Mino de Fiesole y de otros artistas. Sobre las largas paredes están ilustradas paralelamente La Vida De Moisés y la Vida de Cristo, constituyendo un complejo de extraordinarios intereses ejecutados entre el 1481 y el 1483 por Perugino, Botticelli, Cosme Rosselli, Domingo Ghirlandaio con sus respectivos talleres, de las cuales formaban parte Pinturicchio, Piero de Cosme y otros; se agrego luego Lucas de signorelli. Pero el intervencion mas grande y famosa en esta maravillosa capilla es sin lugar a dudas aquel de Miguel Ángel, encargado en el 1508 por Julio II de decorar la cúpula. El tema escogido puede sintetizarse como la representación de la humanidad en la espera de la llegada del Mesías. A distancia de otros 20 anos, el Buonarroti regreso a la Sixtina por encargo de Paolo III (1534-49) para pintar sobre la pared detrás del altar el Juicio Universal. Miguel Ángel trabajo en esta inmensa obra desde el 1536 al 1541.
BIBLIOTECA APOSTOLICA Fundada por el pontífice Nicolo V
PINACOTECA VATICANA Fue fundada por Pio VI (1775-99) esta colocada en la actual Galería de los tapices. Solo en el 1932 esta fue definitivamente arreglada en la sede que hizo construir Pio XI (1922-39) sobre el proyecto del arquitecto Lucas Beltrami. La galería aloja obras de Giotto, Gentile da Fabriano, Beato Angélico, Perugino, Pinturicchio, Leonardo, Tiziano, Guercino, Van Dyck, Poussin y otros mas.
MUSEO GREGORIANO PROFANO El museo gregoriano profano, fundado por Gregorio XVI en el 1844, ha sido inaugurado en los nuevos arreglos del 1970, En las diversas secciones encuentran espacio las colecciones de los grecos originales, las copias y reelaboraciones romanas de los originales grecos, las esculturas romanas de edad republicana y de la primera edad imperial, los sarcófagos y las urnas, las esculturas romanas de épocas mas tardías.
MUSEO PIO CRISTIANO Fue instituido en el 854 por Pio IX, con sede en el Palacio Lateranense, con el fin de reunir las antigüedades cristianas halladas en las excavaciones de las catacumbas. En el 1963 ha sido transferido al Vaticano.
MUSEO MISIONARIO ETNOLOGICO Los materiales son dispuestos según principios didácticos, para documentar los cultos religiosos de las varias civilizaciones que florecían en los otros continentes.
PABELLON DE LAS CARROZAS Donde han sido recogidas las carrozas de los pontífices o de los cardenales, con varias armaduras de caballo.